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Nat Biotechnol:科學(xué)家開發(fā)出有望加速癌癥診斷的新技術(shù)—scTRIP

日期: 2020-01-17
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2020年1月7日 訊 /生物谷BIOON/ --近日,一項刊登在國際雜志Nature Biotechnology上的研究報告中,來自歐洲分子生物學(xué)實驗室等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過研究開發(fā)了一種便宜快速的方法來檢查單一細(xì)胞中的遺傳差異,就能夠接收到的信息而言,該方法的性能優(yōu)于現(xiàn)有的技術(shù),這種新方法有望成為單細(xì)胞研究的新標(biāo)準(zhǔn),并有望用于對包括癌癥在內(nèi)的多種疾病進(jìn)行臨床診斷。

Nat Biotechnol:科學(xué)家開發(fā)出有望加速癌癥診斷的新技術(shù)—scTRIP

圖片來源:CC0 Public Domain

研究者Ashley Sanders說道,我們所開發(fā)的新方法能對單一細(xì)胞的遺傳改變進(jìn)行研究,其或有望改變突變檢測的研究,這種稱之為單細(xì)胞三通道處理(scTRIP,single cell tri-channel processing)的技術(shù)能幫助研究單細(xì)胞中DNA的遺傳變異,并能直接測定信息報中所產(chǎn)生的遺傳突變;相比僅檢測基因組中大規(guī)模改變的現(xiàn)有方法而言,scTRIP技術(shù)能夠細(xì)胞中所發(fā)生的小規(guī)模改變以及利用其它單細(xì)胞方法無法觀察到的多種類型的遺傳變異。

隨后研究人員利用scTRIP技術(shù)在患者機(jī)體的白血病細(xì)胞中進(jìn)行了檢測,在受檢樣本中,研究者發(fā)現(xiàn),利用新技術(shù)所發(fā)現(xiàn)的患者體內(nèi)的變異是標(biāo)準(zhǔn)臨床診斷所檢測到的變異水平的四倍,這包括一個臨床相關(guān)移位缺失,其能驅(qū)動促癌基因的過量表達(dá);此外,研究人員還觀察到了災(zāi)難性的染色體重排,其在最初的白血病診斷過程中往往會被遺漏,當(dāng)一條染色體發(fā)生斷裂并重新按照順序粘貼在一起時就可能會發(fā)生。

研究者Tobias Marschall說道,最初的研究結(jié)果表明,這種新方法明顯優(yōu)于現(xiàn)有的方法,其比目前用來揭示單細(xì)胞中遺傳變異的方法要快得多,同樣也便宜得多,這可能對于臨床應(yīng)有非常有意義;如今研究者開始擴(kuò)展這種方法的應(yīng)用范圍,利用其來分析不同形式的白血病并評估其潛在的臨床效用。由于樣本的異質(zhì)性能在單細(xì)胞水平下進(jìn)行很好地研究,全球的研究人員都在致力于開發(fā)新型技術(shù)來改善所接受到的信息,當(dāng)前的技術(shù)能夠揭示不同的細(xì)胞如何對療法產(chǎn)生反應(yīng),而且迄今為止,相關(guān)的研究和應(yīng)用都集中在測定細(xì)胞內(nèi)RNA的水平上;然而目前測定單細(xì)胞中DNA的水平并未得到應(yīng)用的關(guān)注和重視,對DNA的研究或許有望幫助理解相關(guān)遺傳改變?nèi)绾悟?qū)動不同細(xì)胞行為的發(fā)生,本文中,研究者所開發(fā)的新方法或許就能滿足研究人員和臨床醫(yī)生的需求。

scTRIP技術(shù)能組合單個細(xì)胞的基因組代碼中來自三個不同通道的信息,這就能夠幫助揭示單細(xì)胞中DNA重排的完整圖譜,如今,利用該技術(shù),研究人員就能解決一系列問題,即機(jī)體中的一個細(xì)胞如何有別于癌癥發(fā)生時的任何一個細(xì)胞,scTRIP技術(shù)能夠幫助研究人員直接測定細(xì)胞中所發(fā)生的特殊突變進(jìn)程,從而產(chǎn)生新型遺傳上不同的細(xì)胞群體。后期研究人員還計劃深入研究來研究不同人類細(xì)胞中所發(fā)生的突變過程,同時評估這些差異對人類疾病的影響。(生物谷Bioon.com)


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